トップページをMODxではなくFTPでアップしたページにする設定

これは、ウェブサーバ（Apache）のデフォルト設定がどうなっているかによる話です。

要は「http://*********/」をアクセスした際、サーバによって「index.html」と「index.php」のどちらを優先するかが決まっていますが、FTPで「index.html」をアップしていて、これを表示したいにも関わらず、MODxのページが表示されてしまう場合の設定方法についてです。
（この逆の場合は、単に「index.html」を削除すれば良い話ですね。）

簡単に言うと「.htaccess」ファイルの最初に

DirectoryIndex index.html index.php

と1行挿入すればOKです。

トップページには、新着情報を載せるケースが多いでしょうから、あまり無いケースかもしれませんが、インラインフレームやFlashで新着情報を読み込んで表示するということもたまにあるので。